头孢尼西钠通常耐受较好，最常见的不良反应为肌肉注射时的疼痛感。发生率大于1%的不良反应有。注射部位反应:疼痛不适，静脉注射部位烧灼感，静脉炎。血液系统:血小板增加，嗜酸性粒细胞增多。肝功能实验室检查异常:碱性磷酸酶增加，血清转氨酶(ALT，AST)增加，乳酸脱氢酶(LDH)增加，谷氨酰胺转肽酶(GGTP)增加。发生率小于1%的不良反应有。过敏反应:发热，皮疹，荨麻疹，瘙痒，红斑，肌痛，变态反应，Stevens-Johnson综合症等。胃肠道:恶心，呕吐，腹泻，伪膜性结肠炎。血液系统:白细胞减少，中性粒细胞