头孢哌酮毒性低微，易为病人所耐受，副作用的发生率约为4%，其中以皮疹为多见，达2.3%，少数病人尚有腹泻，腹痛，嗜酸性粒细胞增多，轻度中性粒细胞减少，血小板减少，血小板减少，菌群失调症，应用本品期间饮酒或接受含酒精药物者可出现双硫化样反应。