局部皮肤反应例如：红斑，糜烂，剥脱/剥落和水肿是很常见的。严重的皮肤反应一旦发生，用药部位应用弱碱肥皂和水将乳膏剂洗掉，皮肤反应恢复后可重新再用5%咪喹莫特乳膏剂。少数患者也有肌痛，流感样症状，头痛，腹泻等全身反应均为轻度和中度。