长期服用非那西丁可损害肾脏，甚至诱发癌症。其它可能的不良反应包括紫绀反应及溶血性贫血。由于非那西丁的潜在副作用大，又有其它更安全及同样有效的药物可以代替，所以许多国家已经禁售非那西丁。中华人民共和国已经开始淘汰一些含非那西丁的药品，但并未完全禁止使用。