(1)本品用于治疗疟疾时，不良反应较少，口服一般可能出现的反应有：头晕，头痛，眼花，食欲减退，恶心，呕吐，腹痛，腹泻，皮肤瘙痒，皮疹，甚至剥脱性皮炎，耳鸣，烦躁等。反应大多较轻，停药后可自行消失。(2)在治疗肺吸虫病，华支睾吸虫病及结缔组织疾病时，用药量大，疗程长，可能会有较重的反应，常见者为对眼的毒性，因氯喹可由泪腺分泌，并由角膜吸收，在角膜上出现弥漫性白色颗粒，停药后可消失。(3)本品相当部分在组织内蓄积，久服可致视网膜轻度水肿和色素聚集，出现暗点，影响视力，常为不可逆。(4)氯喹还可损害听力，妊娠妇