盐酸托烷司琼通常耐受性良好，推荐剂量项下的不良反应为一过性。常见的不良反应有头痛，头昏，便秘，眩晕，疲劳和胃肠功能紊乱如腹痛和腹泻等。极少数病人可能出现一过性血压改变或过敏反应，前者无需特殊治疗，后者经抗过敏治疗后可好转。