在已报告的伊曲康唑的不良反应中常见胃肠道不适，如厌食、恶心，腹痛和便秘；少见的副作用包括头痛、可逆性肝酶升高、月经紊乱，头晕和过敏反应(如瘙痒、红斑、风团和血管性水肿)。有个例报告出现了外周神经病变和Stevens-Johnson综合症(重症多形红斑)，但后者的原因不明。已有重要的潜在病理改变并同时接受多种药物治疗的大多数患者，在接受伊曲康唑分散片长疗程疗程(约一个月以上)治疗时，可见低血钾症、水肿、肝炎和脱发等症状。